11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31531 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_31531  predicted protein  100 
 
 
414 aa  860    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.288827  normal  0.0593553 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01330  endodeoxyribonuclease, putative  26.54 
 
 
559 aa  66.6  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0861  DNA topoisomerase VI subunit A  23.49 
 
 
367 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0732584 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0943  DNA topoisomerase VI subunit A  24.9 
 
 
367 aa  53.1  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1927  DNA topoisomerase VI subunit A  24.9 
 
 
367 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1552  DNA topoisomerase VI subunit A  23.21 
 
 
369 aa  50.4  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.774461  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1392  DNA topoisomerase VI subunit A  24.08 
 
 
367 aa  49.7  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24838  type II DNA topoisomerase VI subunit  29.65 
 
 
430 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0667  DNA topoisomerase VI subunit A  25.91 
 
 
379 aa  48.9  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36531  type II DNA topoisomerase VI subunit  26.37 
 
 
432 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08259  spo11 homologue spoA (Eurofung)  29.41 
 
 
328 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.519645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>