13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49534 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_49534  predicted protein  100 
 
 
610 aa  1255    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47802  predicted protein  51.15 
 
 
600 aa  513  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1237  biopterin transport-related protein BT1  27.73 
 
 
472 aa  146  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122493  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4368  folate/biopterin transporter  27.29 
 
 
441 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4307  folate/biopterin transporter  27.07 
 
 
441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0448  folate/biopterin transporter  25.98 
 
 
483 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5114  folate/biopterin transporter  25.97 
 
 
454 aa  133  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0603297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4223  folate/biopterin transporter  26.9 
 
 
468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0325732 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21970  predicted protein  26.57 
 
 
495 aa  131  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00490278  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0197  folate/biopterin transporter  28.19 
 
 
453 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3211  folate/biopterin transporter  26.3 
 
 
458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12682  FBT family transporter: folate/pteridine  25.61 
 
 
429 aa  117  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.415206  normal  0.304325 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  33.57 
 
 
428 aa  44.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>