11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49418 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_49418  predicted protein  100 
 
 
597 aa  1219    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162905  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49420  predicted protein  45.57 
 
 
621 aa  482  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03890  magnesium ion transporter, putative  29.5 
 
 
282 aa  63.5  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07826  mitochondrial CorA family metal ion transporter (Eurofung)  24.23 
 
 
396 aa  60.1  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40656  MIT family transporter: magnesium ion  22.31 
 
 
405 aa  58.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0120693  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47013  mitochondrial MRS2-like protein  32.38 
 
 
365 aa  57.8  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37260  predicted protein  25.77 
 
 
448 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59952  mitochondrial magnesium ion transporter  24.14 
 
 
400 aa  52.4  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677897  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11107  hypothetical protein similar to CorA-like transorter protein (Eurofung)  28.57 
 
 
594 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32899  MIT family transporter: magnesium/cobalt ion  23.12 
 
 
373 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.782557 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16814  predicted protein  27.89 
 
 
364 aa  48.1  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.173112  hitchhiker  0.00328621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>