17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48012 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_48012  predicted protein  100 
 
 
617 aa  1270    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_51110  predicted protein  25.47 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.09931  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_42322  predicted protein  25.47 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.942798  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04563  casein kinase I (Eurofung)  23.84 
 
 
370 aa  65.1  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0109457  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05390  casein kinase I, putative  24.69 
 
 
459 aa  65.1  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14134  predicted protein  23.72 
 
 
295 aa  61.2  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67511  casein kinase I  23.38 
 
 
417 aa  61.2  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.347533  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05757  casein kinase I homolog, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06870)  23.84 
 
 
444 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873859  normal  0.0412254 
 
 
-
 
NC_006686  CND04310  protein kinase, putative  23.17 
 
 
331 aa  59.3  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24026  predicted protein  26.87 
 
 
601 aa  58.5  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41984  predicted protein  24.11 
 
 
325 aa  56.6  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0592506  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65270  casein kinase I  25.42 
 
 
474 aa  56.2  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.182659  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89119  casein kinase I  22.82 
 
 
450 aa  54.7  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.6844  normal  0.535442 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_7026  predicted protein  36.36 
 
 
102 aa  47.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.268251  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21821  predicted protein  25.78 
 
 
311 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.563947  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00940  protein kinase, putative  21.96 
 
 
428 aa  45.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl221  serine/threonine protein kinase  23.31 
 
 
386 aa  43.9  0.008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>