12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47578 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47578  predicted protein  100 
 
 
333 aa  681    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03851  conserved hypothetical protein  33.08 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355606  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32441  predicted protein  27.41 
 
 
380 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07290  conserved hypothetical protein  27.98 
 
 
250 aa  50.8  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10539  hypothetical protein  29.32 
 
 
247 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.041688  hitchhiker  0.000199182 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10134  glucose-inducible SAM-dependent methyltransferase Rrg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16310)  33.02 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92228  predicted protein  26.67 
 
 
214 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92828  predicted protein  27.45 
 
 
566 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41150  predicted protein  30.27 
 
 
347 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.216905  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  29.08 
 
 
221 aa  43.5  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  31.78 
 
 
246 aa  43.5  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39038  predicted protein  27.14 
 
 
289 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>