20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43168 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_43168  predicted protein  100 
 
 
282 aa  588  1e-167  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0764415  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2883  hypothetical protein  28.32 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26660  hypothetical protein  28.32 
 
 
289 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.0470074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5394  hypothetical protein  28.29 
 
 
343 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1931  hypothetical protein  27.6 
 
 
287 aa  99  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0412826  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2209  hypothetical protein  28 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131678  normal  0.543149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2065  hypothetical protein  27.59 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.379601  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1065  hypothetical protein  28.62 
 
 
289 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390948  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0945  hypothetical protein  25.1 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333132  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3166  hypothetical protein  26.79 
 
 
298 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.578089  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2315  hypothetical protein  26.32 
 
 
259 aa  89  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15037  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2382  hypothetical protein  24.73 
 
 
293 aa  86.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.956505  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1346  hypothetical protein  26 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0182912  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3395  2OG-Fe(II) oxygenase  24.71 
 
 
269 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4124  2OG-Fe(II) oxygenase  24.71 
 
 
269 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4242  2OG-Fe(II) oxygenase  24.71 
 
 
269 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1911  2OG-Fe(II) oxygenase  23.95 
 
 
268 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4468  2OG-Fe(II) oxygenase  23.41 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342979  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4297  2OG-Fe(II) oxygenase  24.4 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743423  normal  0.368434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3873  2OG-Fe(II) oxygenase  24.3 
 
 
289 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0524705  normal  0.85637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>