13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_21323 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_21323  predicted protein  100 
 
 		 137 aa  277  4e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42986  Ribosomal protein S24, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  58.68 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127832  normal  0.243183 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09097  37S ribosomal protein S24 (AFU_orthologue; AFUA_7G02140)  54.47 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.133794  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87922  ribosomal protein S24  54.92 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04480  structural constituent of ribosome, putative  51.91 
 
 		 172 aa  111  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.287785  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0565  Ribosomal protein S24e  36.67 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0448  ribosomal protein S24e  31.46 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1324  ribosomal protein S24e  30.21 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0283  30S ribosomal protein S24e  32.56 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.568514  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1956  30S ribosomal protein S24e  28.09 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2222  30S ribosomal protein S24e  25 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000329506 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1171  Ribosomal protein S24e  29 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.538794  normal  0.934436 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0600  Ribosomal protein S24e  29.21 
 
 		 98 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>