17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1943 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1943  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  880    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0075  hypothetical protein  22.83 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1312  hypothetical protein  28.04 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.667333 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0866  hypothetical protein  26.45 
 
 
406 aa  63.2  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3152  hypothetical protein  32.58 
 
 
466 aa  63.2  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.416399 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2453  hypothetical protein  31.36 
 
 
233 aa  63.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.438658  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4660  hypothetical protein  22.54 
 
 
322 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2578  hypothetical protein  22.38 
 
 
280 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.149067 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4814  hypothetical protein  28.74 
 
 
425 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6305  hypothetical protein  21.82 
 
 
331 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2038  hypothetical protein  27.01 
 
 
351 aa  53.5  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0582  hypothetical protein  26.09 
 
 
354 aa  53.1  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0511  hypothetical protein  30.34 
 
 
229 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12173  hypothetical protein  25.29 
 
 
361 aa  51.6  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0582  hypothetical protein  31.87 
 
 
378 aa  50.8  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0242426  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2336  hypothetical protein  23.66 
 
 
354 aa  49.7  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0899485  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1391  hypothetical protein  28.57 
 
 
245 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>