9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0254 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0254    100 
 
 
385 bp  763    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0251    98.96 
 
 
385 bp  731    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.48928  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2795    97.39 
 
 
701 bp  605  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3681    93 
 
 
687 bp  440  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3735    93 
 
 
692 bp  440  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000165595  normal  0.066481 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3455    94.35 
 
 
635 bp  373  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3322  hypothetical protein  96.17 
 
 
183 bp  299  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2338  hypothetical protein  94 
 
 
234 bp  75.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5050    88.68 
 
 
1260 bp  58  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>