47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2981 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  100 
 
 		 557 aa  1145    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  28.52 
 
 		 559 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  28.25 
 
 		 586 aa  200  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  24.33 
 
 		 510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  23.92 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4770  GH3 auxin-responsive promoter  25.59 
 
 		 581 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0973169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  24.07 
 
 		 508 aa  114  7.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  23.93 
 
 		 507 aa  113  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  24.21 
 
 		 504 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  26.48 
 
 		 504 aa  107  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  24.11 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4515  GH3 auxin-responsive promoter  26.64 
 
 		 526 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  25.13 
 
 		 495 aa  103  9e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2824  auxin-responsive GH3-related protein  23.77 
 
 		 487 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0537258  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2698  GH3 auxin-responsive promoter  26.95 
 
 		 417 aa  93.6  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  25.43 
 
 		 502 aa  92  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1029  GH3 auxin-responsive promoter  23.77 
 
 		 510 aa  90.1  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00063016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  23.38 
 
 		 484 aa  87.8  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0495  GH3 auxin-responsive promoter  26.19 
 
 		 528 aa  81.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.527563 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2150  hypothetical protein  22.91 
 
 		 509 aa  74.7  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2176  hypothetical protein  23.65 
 
 		 509 aa  73.6  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1664  GH3 auxin-responsive promoter  23.57 
 
 		 514 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0394  GH3 auxin-responsive promoter  21.54 
 
 		 547 aa  71.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.20196  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0949  GH3 auxin-responsive promoter  23.64 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.424251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0805  auxin-responsive GH3-related protein  23.64 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0740  auxin-responsive GH3-related protein  30.43 
 
 		 532 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  26.62 
 
 		 521 aa  70.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  24.68 
 
 		 497 aa  70.5  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  21.44 
 
 		 530 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  25.51 
 
 		 502 aa  68.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  23.65 
 
 		 509 aa  68.9  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  36.78 
 
 		 507 aa  64.3  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  26.22 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  22.74 
 
 		 527 aa  60.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  23.28 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  30.3 
 
 		 510 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0144  GH3 auxin-responsive promoter  23.53 
 
 		 522 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  28.74 
 
 		 500 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2660  auxin-regulated like  26.44 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0617  GH3 auxin-responsive promoter  21.28 
 
 		 528 aa  55.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  26.84 
 
 		 496 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1542  hypothetical protein  29.66 
 
 		 128 aa  55.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  21.69 
 
 		 562 aa  53.9  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0118  GH3 auxin-responsive promoter  20.98 
 
 		 508 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.086469 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1190  GH3 auxin-responsive promoter  20.35 
 
 		 543 aa  47.8  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.259231  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12318  hypothetical protein  32.2 
 
 		 507 aa  46.6  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  25.1 
 
 		 539 aa  43.9  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>