17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1730 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1730  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  338  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000514392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0803  conserved hypothetical phage tail protein  30.91 
 
 
155 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1729  hypothetical protein  33.77 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000276376 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1728  conserved hypothetical phage tail protein  35.71 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000263815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  35.71 
 
 
159 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1423  hypothetical protein  26.22 
 
 
160 aa  58.5  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26530  conserved hypothetical phage tail region protein  30 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.167509  normal  0.504413 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  27.85 
 
 
145 aa  54.3  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1058  hypothetical protein  28.24 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  38.6 
 
 
146 aa  51.2  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  38.6 
 
 
146 aa  51.2  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  25.79 
 
 
149 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  22.98 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0931  phage tail protein  33.87 
 
 
150 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339945  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1900  hypothetical protein  30 
 
 
147 aa  41.6  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0408568  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  25 
 
 
142 aa  40.8  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  25.97 
 
 
146 aa  40.4  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>