17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3494 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3494  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2655  hypothetical protein  37.5 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00248341  unclonable  0.0000000268429 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0233  hypothetical protein  38.34 
 
 		 197 aa  144  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5443  hypothetical protein  35.23 
 
 		 197 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5419  hypothetical protein  35.23 
 
 		 197 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.257905  normal  0.0113948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4850  hypothetical protein  35.23 
 
 		 197 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5306  hypothetical protein  36.79 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2964  hypothetical protein  39.89 
 
 		 190 aa  128  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4760  hypothetical protein  34.72 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.785775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2486  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0273408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1063  hypothetical protein  33.71 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0325013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1709  hypothetical protein  35.2 
 
 		 196 aa  98.2  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0544  hypothetical protein  30.86 
 
 		 185 aa  85.9  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0426  hypothetical protein  29.14 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125949  hitchhiker  0.0000334915 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70220  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1128  hypothetical protein  36.07 
 
 		 64 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00652499  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1465  hypothetical protein  23.98 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>