26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3128 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3128  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  235  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1150  hypothetical protein  98.26 
 
 		 115 aa  233  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2835  hypothetical protein  84.35 
 
 		 115 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1017  hypothetical protein  82.47 
 
 		 115 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1022  hypothetical protein  71.03 
 
 		 108 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4000  hypothetical protein  73.27 
 
 		 116 aa  162  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0670  hypothetical protein  64.35 
 
 		 153 aa  157  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000435757  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0129  hypothetical protein  64.35 
 
 		 115 aa  156  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00178976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00120  hypothetical protein  64.35 
 
 		 115 aa  156  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0106649  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00121  hypothetical protein  64.35 
 
 		 115 aa  156  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0136947  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0115  hypothetical protein  64.35 
 
 		 115 aa  156  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000937496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0132  hypothetical protein  64.35 
 
 		 115 aa  156  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3537  hypothetical protein  64.35 
 
 		 115 aa  156  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00221389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0124  hypothetical protein  64.35 
 
 		 115 aa  156  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.621631  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0127  hypothetical protein  64.35 
 
 		 115 aa  156  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000275636  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3480  conserved hypothetical protein  64.35 
 
 		 115 aa  156  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00125403  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0191  hypothetical protein  63.48 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3481  hypothetical protein  72 
 
 		 115 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.264996  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3353  hypothetical protein  72 
 
 		 115 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000420565  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0182  hypothetical protein  63.48 
 
 		 115 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0186  hypothetical protein  63.48 
 
 		 115 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.448857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0183  hypothetical protein  63.48 
 
 		 115 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0199  hypothetical protein  65.74 
 
 		 108 aa  154  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1467  lipoprotein, PulS/OutS family  36.08 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1296  lipoprotein, PulS/OutS family  31.18 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1408  lipoprotein, PulS/OutS family  32.47 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>