60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2663 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2663  phage major tail tube protein  100 
 
 		 171 aa  352  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2301  phage major tail tube protein  50.29 
 
 		 171 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2188  tail tube protein  50.29 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2348  phage major tail tube protein  50.29 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0862  phage major tail tube protein  52.05 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.189213  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3030  phage major tail tube protein FII  50.29 
 
 		 171 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222332 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2847  phage major tail tube protein FII  50.29 
 
 		 171 aa  173  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1814  phage major tail tube protein  50.58 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00232841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2755  phage major tail tube protein  50.29 
 
 		 171 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000395908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0943  phage major tail tube protein  50.29 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4384  phage major tail tube protein  50.58 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  hitchhiker  0.00216256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2492  phage major tail tube protein FII  50.29 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.821956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2100  phage major tail tube protein  51.74 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2894  phage major tail tube protein  50.29 
 
 		 171 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3193  phage major tail tube protein  51.16 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3481  phage major tail tube protein  51.74 
 
 		 172 aa  168  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0860843 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3029  phage major tail tube protein FII  48.26 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4346  phage major tail tube protein FII  48.26 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3309  phage major tail tube protein  49.71 
 
 		 170 aa  156  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01343  phage major tail tube protein  45.29 
 
 		 169 aa  155  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.822943  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37390  Phage P2 FII-like protein  45.61 
 
 		 171 aa  154  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4857  phage major tail tube protein  43.27 
 
 		 169 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.662174  normal  0.797605 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2674  phage major tail tube protein  46.51 
 
 		 170 aa  151  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0110743 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0184  phage major tail tube protein  45.03 
 
 		 169 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2591  phage major tail tube protein  43.27 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.213211  hitchhiker  0.0000000491617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2625  phage major tail tube protein  43.27 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169014  hitchhiker  0.000000417422 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1917  phage major tail tube-like protein  43.86 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1378  phage major tail tube protein  42.69 
 
 		 170 aa  139  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.304056  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1330  phage major tail tube protein  40.35 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0748  Phage major tail tube protein  40 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.17679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0766  phage major tail tube protein  39.05 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08090  putative phage tail tube protein  37.87 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  8.01522e-16  hitchhiker  0.000177161 
 
 
-
 
NC_002978  WD0574  contractile tail tube protein  39.05 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3060  pyocin R2_PP, tail tube protein  34.32 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.167216 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4039  phage major tail tube protein  34.91 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3395  major tail tube protein  34.32 
 
 		 169 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1213  phage major tail tube protein  33.14 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024184 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0886  phage major tail tube protein  38.55 
 
 		 167 aa  95.5  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0396  hypothetical protein  34.3 
 
 		 169 aa  95.1  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1135  hypothetical protein  34.3 
 
 		 169 aa  95.1  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1157  phage major tail tube protein  33.72 
 
 		 169 aa  94.7  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1859  phage major tail tube protein  30.77 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1283  phage major tail tube protein  30.99 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.299866 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6178  putative phage tail tube protein FII  29.14 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.672659  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4552  phage major tail tube protein  26.06 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845098  normal  0.36933 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2896  phage major tail tube protein  27.78 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1566  phage major tail tube protein  27.78 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4553  phage major tail tube protein  26.06 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00640021  normal  0.47979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4468  phage major tail tube protein  26.06 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1629  contractile tail tube protein  31.45 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2918  prophage MuMc02, major tail tube protein  27.38 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0578  major tail tube protein  26.57 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4129  major tail tube protein  24.66 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4913  major tail tube protein  26.59 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.79604 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0924  major tail tube protein  22.02 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2377  phage major tail tube protein  24.82 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01997  hypothetical protein  25.88 
 
 		 168 aa  50.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2294  phage major tail tube protein  24.11 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3325  phage major tail tube protein  24.11 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1213  phage major tail tube protein  24.14 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.443458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>