53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1566 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1566  phage major tail tube protein  100 
 
 		 174 aa  363  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2896  phage major tail tube protein  100 
 
 		 174 aa  363  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4553  phage major tail tube protein  76.44 
 
 		 174 aa  292  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00640021  normal  0.47979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4468  phage major tail tube protein  76.44 
 
 		 174 aa  292  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4552  phage major tail tube protein  75.86 
 
 		 174 aa  290  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845098  normal  0.36933 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2918  prophage MuMc02, major tail tube protein  47.67 
 
 		 173 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4857  phage major tail tube protein  27.98 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.662174  normal  0.797605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0184  phage major tail tube protein  27.98 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0766  phage major tail tube protein  26.19 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08090  putative phage tail tube protein  26.19 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  8.01522e-16  hitchhiker  0.000177161 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0748  Phage major tail tube protein  29.17 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.17679 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1814  phage major tail tube protein  27.54 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00232841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01343  phage major tail tube protein  29.19 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.822943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2663  phage major tail tube protein  27.78 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4346  phage major tail tube protein FII  27.44 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3029  phage major tail tube protein FII  27.44 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836239 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4913  major tail tube protein  29.55 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.79604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3395  major tail tube protein  25 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2894  phage major tail tube protein  25 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1330  phage major tail tube protein  25.44 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0862  phage major tail tube protein  26.71 
 
 		 169 aa  62  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.189213  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4039  phage major tail tube protein  25 
 
 		 169 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1917  phage major tail tube-like protein  28.05 
 
 		 169 aa  62  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2100  phage major tail tube protein  25.75 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1213  phage major tail tube protein  25 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024184 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3193  phage major tail tube protein  26.83 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0396  hypothetical protein  23.64 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1135  hypothetical protein  23.64 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1157  phage major tail tube protein  23.64 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3060  pyocin R2_PP, tail tube protein  23.21 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.167216 
 
 
-
 
NC_002978  WD0574  contractile tail tube protein  26.67 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37390  Phage P2 FII-like protein  25.7 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4384  phage major tail tube protein  26.83 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  hitchhiker  0.00216256 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1213  phage major tail tube protein  22.81 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.443458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2591  phage major tail tube protein  21.82 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.213211  hitchhiker  0.0000000491617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2625  phage major tail tube protein  21.82 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169014  hitchhiker  0.000000417422 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2301  phage major tail tube protein  25.86 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2348  phage major tail tube protein  25.86 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2188  tail tube protein  25.86 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3030  phage major tail tube protein FII  23.21 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222332 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3309  phage major tail tube protein  21.89 
 
 		 170 aa  52  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2847  phage major tail tube protein FII  22.62 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3481  phage major tail tube protein  25 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0860843 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6178  putative phage tail tube protein FII  21.34 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.672659  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2492  phage major tail tube protein FII  22.62 
 
 		 171 aa  48.1  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.821956  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0943  phage major tail tube protein  22.62 
 
 		 171 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2755  phage major tail tube protein  22.62 
 
 		 171 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000395908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0886  phage major tail tube protein  25.3 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0924  major tail tube protein  21.34 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2294  phage major tail tube protein  22.75 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1378  phage major tail tube protein  22.35 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.304056  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3325  phage major tail tube protein  23.35 
 
 		 171 aa  42  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489725  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2377  phage major tail tube protein  33.9 
 
 		 171 aa  42  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>