39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1073 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1073  Primosomal replication priB and priC  100 
 
 		 178 aa  346  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3238  Primosomal replication priB and priC  95.51 
 
 		 178 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104789  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3043  Primosomal replication priB and priC  67.23 
 
 		 177 aa  224  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1132  primosomal replication priB and priC  63.48 
 
 		 178 aa  221  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3202  primosomal replication priB and priC  58.24 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2885  primosomal replication protein n''  58.24 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1015  Primosomal replication priB and priC  63.48 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.265941  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3062  primosomal replication protein n''  58.24 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0541  primosomal replication protein N''  44.51 
 
 		 175 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0525  primosomal replication protein N''  44.51 
 
 		 175 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0531  primosomal replication protein N''  44.64 
 
 		 171 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0585  primosomal replication protein N''  44.64 
 
 		 171 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0522  primosomal replication protein N''  44.64 
 
 		 171 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0947  primosomal replication protein N''  41.04 
 
 		 175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.815884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0544  primosomal replication protein N''  39.31 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3149  primosomal replication protein N''  39.31 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.373691 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0510  primosomal replication protein N''  39.88 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00536071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0399  primosomal replication protein N''  39.88 
 
 		 175 aa  108  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.436694  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0503  primosomal replication protein N''  39.31 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.151762  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00423  hypothetical protein  39.31 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0862408  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00418  primosomal replication protein N''  39.31 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0764995  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3143  Primosomal replication priB and priC  39.31 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0557  primosomal replication protein N''  38.73 
 
 		 175 aa  104  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0959641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1127  primosomal replication protein N''  39.22 
 
 		 186 aa  87.8  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1448  primosomal replication protein N``  36.77 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000618679  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003965  primosomal replication protein N''  34.64 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0128436  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01555  primosomal replication protein N''  35.33 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3758  putative primosomal replication protein N''  42.03 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1511  primosomal replication protein N'', putative  22.07 
 
 		 220 aa  47.8  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2632  primosomal replication protein N'', putative  22.38 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.945  hitchhiker  0.00346674 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2472  primosomal replication protein N'', putative  22.38 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169187 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2540  primosomal replication protein N'', putative  22.38 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171474 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1650  primosomal replication protein N'', putative  21.9 
 
 		 220 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1616  primosomal replication protein N'', putative  21.9 
 
 		 220 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1627  primosomal replication protein N'', putative  21.9 
 
 		 220 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2727  primosomal replication protein N'', putative  21.9 
 
 		 220 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.794988  hitchhiker  0.000571866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1817  primosomal replication protein n'', putative  21.9 
 
 		 222 aa  44.7  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1247  primosomal replication protein N'', putative  24.2 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103965 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2658  primosomal replication protein N'', putative  23.53 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>