17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_70220 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_70220  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2964  hypothetical protein  67.92 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2486  hypothetical protein  65.91 
 
 
192 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0273408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1709  hypothetical protein  60.47 
 
 
196 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0233  hypothetical protein  56 
 
 
197 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4760  hypothetical protein  58.82 
 
 
219 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.785775  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5306  hypothetical protein  58.82 
 
 
197 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.012971  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4850  hypothetical protein  60.87 
 
 
197 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5419  hypothetical protein  60.87 
 
 
197 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.257905  normal  0.0113948 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5443  hypothetical protein  60.87 
 
 
197 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594952  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1063  hypothetical protein  68.18 
 
 
188 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0325013  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2655  hypothetical protein  49.02 
 
 
213 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00248341  unclonable  0.0000000268429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0544  hypothetical protein  58.7 
 
 
185 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3494  hypothetical protein  50 
 
 
195 aa  50.1  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1128  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00652499  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0426  hypothetical protein  48.15 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125949  hitchhiker  0.0000334915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0165  hypothetical protein  46.81 
 
 
185 aa  40.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>