19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47320 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_47320  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  358  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4083  hypothetical protein  97.13 
 
 		 174 aa  321  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3908  hypothetical protein  50.29 
 
 		 174 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3887  hypothetical protein  47.4 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4102  hypothetical protein  47.4 
 
 		 173 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1577  hypothetical protein  49.43 
 
 		 174 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1309  hypothetical protein  46.82 
 
 		 173 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000696984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4580  hypothetical protein  50.67 
 
 		 173 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1402  hypothetical protein  51.97 
 
 		 180 aa  167  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1785  hypothetical protein  57.23 
 
 		 174 aa  166  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0605604  normal  0.726112 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0542  hypothetical protein  42.48 
 
 		 173 aa  144  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3642  hypothetical protein  35.71 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0214  hypothetical protein  38.76 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2685  hypothetical protein  37.8 
 
 		 195 aa  103  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  hitchhiker  0.000194293 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2923  hypothetical protein  21.53 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3102  hypothetical protein  20.83 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3005  hypothetical protein  20.39 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1694  hypothetical protein  31.11 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1089  hypothetical protein  19.44 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.429336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>