13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_45260 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_45260  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3843  putative lipoprotein  94.2 
 
 		 137 aa  223  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2782  hypothetical protein  49.23 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.981039  normal  0.95643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4319  hypothetical protein  45.26 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.860691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3887  hypothetical protein  45.93 
 
 		 138 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1549  hypothetical protein  44.53 
 
 		 138 aa  103  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3644  hypothetical protein  44.6 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0205183  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3626  lipoprotein, putative  41.84 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1586  hypothetical protein  52.5 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3384  putative lipoprotein  42.25 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30360  hypothetical protein  38.89 
 
 		 155 aa  83.6  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3121  hypothetical protein  45 
 
 		 108 aa  52  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310321  normal  0.0170994 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1471  hypothetical protein  35 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>