12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_28200 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_28200  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  286  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050944  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0147  hypothetical protein  53.23 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1631  hypothetical protein  41.67 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000804863  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6521  hypothetical protein  45.54 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1188  hypothetical protein  42 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1967  hypothetical protein  36.21 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.878388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3450  hypothetical protein  33.93 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4293  hypothetical protein  34.26 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.910498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4073  hypothetical protein  34.26 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4056  hypothetical protein  28.37 
 
 		 241 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4554  hypothetical protein  27.69 
 
 		 232 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1018  hypothetical protein  26.28 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333587  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>