11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_27590 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_27590  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00959157 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2335  hypothetical protein  98.83 
 
 
257 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0156027  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1915  hypothetical protein  64.59 
 
 
255 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0846835  normal  0.46148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1487  hypothetical protein  62.65 
 
 
255 aa  299  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1878  hypothetical protein  61.09 
 
 
255 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.192229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3837  hypothetical protein  60.7 
 
 
280 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1453  hypothetical protein  60.31 
 
 
255 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.150556 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1785  hypothetical protein  58.75 
 
 
256 aa  291  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3609  hypothetical protein  57.71 
 
 
252 aa  281  9e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0064832  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4191  hypothetical protein  61.66 
 
 
252 aa  278  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1168  hypothetical protein  19.7 
 
 
263 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000323941  hitchhiker  0.00000154553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>