23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_12550 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_12550  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  268  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1142  hypothetical protein  99.23 
 
 		 130 aa  266  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.927544  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3744  globin  74.62 
 
 		 130 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0016  hypothetical protein  53.85 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1516  globin  35.43 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.388505  hitchhiker  0.00210145 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000359  hypothetical protein  32.81 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3305  hypothetical protein  29.46 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634676  hitchhiker  0.000000243296 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.65 
 
 		 402 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.69 
 
 		 402 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.69 
 
 		 402 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  33.65 
 
 		 402 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  32.69 
 
 		 402 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  30.28 
 
 		 402 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  30.28 
 
 		 402 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  30.28 
 
 		 402 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  30.28 
 
 		 402 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  31.73 
 
 		 402 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  31.73 
 
 		 402 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1666  putative flavohemoglobin  33.33 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164309  normal  0.0539041 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  30.28 
 
 		 399 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  30.28 
 
 		 402 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4918  globin  29.41 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163217  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  29.36 
 
 		 402 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>