12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_11880 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_11880  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1091  hypothetical protein  98.75 
 
 		 97 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3823  hypothetical protein  82.14 
 
 		 95 aa  144  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08050  hypothetical protein  64.94 
 
 		 98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0731  lipoprotein, putative  69.23 
 
 		 98 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0549  hypothetical protein  72.62 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.560203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4985  hypothetical protein  72.5 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0588  hypothetical protein  72.62 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0632  hypothetical protein  73.75 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.476647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0594  hypothetical protein  73.42 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.528316  normal  0.0741691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0601  hypothetical protein  70.73 
 
 		 88 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1368  lipoprotein, putative  39.08 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00111167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>