49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_11280 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_11280  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  342  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1036  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  337  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3866  hypothetical protein  66.23 
 
 		 173 aa  197  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0558  lipoprotein  58.96 
 
 		 171 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  0.717571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5028  putative lipoprotein  61.69 
 
 		 172 aa  190  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0550  lipoprotein  63.76 
 
 		 190 aa  188  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0505  putative lipoprotein  62.25 
 
 		 212 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0127462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0540  hypothetical protein  62.25 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4472  putative lipoprotein  53.93 
 
 		 174 aa  180  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0680  lipoprotein, putative  57.86 
 
 		 174 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06620  hypothetical protein  59.87 
 
 		 171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00217  lipoprotein, putative  41.57 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0142  hypothetical protein  46.25 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.143516  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01230  hypothetical protein  43.2 
 
 		 195 aa  121  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3430  hypothetical protein  38.75 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0141  hypothetical protein  41.21 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001702  hypothetical protein  38.69 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1814  hypothetical protein  32.78 
 
 		 189 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.660387  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1973  hypothetical protein  43.8 
 
 		 232 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1562  hypothetical protein  42 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5045  hypothetical protein  42.57 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.110017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5491  hypothetical protein  42.57 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2156  hypothetical protein  37.34 
 
 		 183 aa  111  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.811392 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00771  hypothetical protein  39.63 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6211  hypothetical protein  42.28 
 
 		 182 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71580  hypothetical protein  42.95 
 
 		 182 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3393  hypothetical protein  38.56 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191739  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0305  hypothetical protein  42.57 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0115  hypothetical protein  41.88 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0425  hypothetical protein  46.85 
 
 		 161 aa  108  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2133  hypothetical protein  39.73 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3492  hypothetical protein  38.67 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5619  hypothetical protein  49.47 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774523  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1829  hypothetical protein  39.51 
 
 		 203 aa  100  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5333  hypothetical protein  38.61 
 
 		 189 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5241  hypothetical protein  40.14 
 
 		 177 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98466  normal  0.106495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1843  hypothetical protein  38.96 
 
 		 192 aa  97.8  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3556  hypothetical protein  36.42 
 
 		 190 aa  96.7  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5382  hypothetical protein  39.55 
 
 		 177 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0703  hypothetical protein  31.95 
 
 		 204 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00895458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2155  hypothetical protein  40.4 
 
 		 206 aa  91.7  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4181  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  84.3  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.526119 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05705  hypothetical protein  38.54 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2285  hypothetical protein  30.37 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0303  hypothetical protein  29.56 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.965134  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3621  hypothetical protein  31.86 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3013  hypothetical protein  32.04 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.195597  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4728  hypothetical protein  29.73 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0644  hypothetical protein  32.93 
 
 		 335 aa  41.2  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>