Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
Locus tag | P9301_06151 |
Symbol | |
ID | 4911321 |
Type | CDS |
Is gene spliced | No |
Is pseudo gene | No |
Organism name | Prochlorococcus marinus str. MIT 9301 |
Kingdom | Bacteria |
Replicon accession | NC_009091 |
Strand | + |
Start bp | 538670 |
End bp | 542560 |
Gene Length | 3891 bp |
Protein Length | 1296 aa |
Translation table | 11 |
GC content | 26% |
IMG OID | 640160196 |
Product | hypothetical protein |
Protein accession | YP_001090839 |
Protein GI | 126695953 |
COG category | |
COG ID | |
TIGRFAM ID | |
|
|
Plasmid Coverage information |
Num covering plasmid clones | 0 |
Plasmid unclonability p-value | 1 |
Plasmid hitchhiking | No |
Plasmid clonability | normal |
| |
Fosmid Coverage information |
Num covering fosmid clones | n/a |
Fosmid unclonability p-value | n/a |
Fosmid Hitchhiker | n/a |
Fosmid clonability | n/a |
| |
Sequence |
Gene sequence | ATGCTTTTAC CCTTAGGTTT TTTAAGCTCT ATTTTATTAA ATAATTTTTT AAAAGAAACT TATAGTTCTA AGAAATTAGA ACTAGAAAAA AGTATTGAGA ATCTTTTAGA TAAAAATGTT GATTTAGGGG ATTATGAAGG GCTTAGATTT CTGGGTATTT CTTTGGGCAA TTCAAAAATT AATGATAAAA AAAATATAGA TTCTGAAATT AAAGCTAACA ATGTATATGT GGGCATTATG CCTTTAAGAT CTTTTTTAAA ACAAAAATGG ATTGTAAAAA TAAGTCCTAA GGAAGCCGCT TTAAATATAG ATAGAGATTT TTTTAAAAGG GAAAAATCCT ATGAAAATGA TCGAATTACA AAAAAATCAC AATCAAATTA TGAATTGAAT TTTAACTTAA GCAAATATTC AATTCTAAAT CTTAAAAAAT CAGGATTAAA AACAAAAGTA AAAGGTAACG TCATTTATAA GTCGAGTAAT AGAGAAATTA TTGCAAATGT AAAATCAAAT TTTGATGAAA AAGGTTTTTT AAAATTTAAA TTTAATACAA AATTAAATAA AGACTTTTTA TCTCTTGAGT TATTTTCAAG GGGTTTAGAT CTTGATAATT CTGAATATAT TATTGGTAAT AGAAAAATTA GTTTTAAAAA AGGAAATTTT AAATCTAATT TTAAATTGAT TAAATTACCA AATGAAACCT TTTGCAAAGG AAGATTTTCT TTTACTAATT TAAAAATAAA ACCAGATGAT TTCGCAGAGA ATATAGATTC AGATTCAACT AGGTTTTTGT GTAAAGATAA TAATTTAATT GGTAATTCAG AAAAATTAAA TTATGGAACG TTAACTTCGA ATTTTAATCT AAATATTCCA TTTAATAGAA GTTCAAATAT TATTGCTCTA AAAGGAAGTA TTGGATACAT TAATAGTCTT AATCCAGATA TCCAATTATC AGGTAATATC CCCTTTTGGT TTGATAGAAG AGGTATTAAT TTTGGTGATA TAGATACTAG TTTTAAAATA AATAGAACTC AATTATCTAA TTTAAATATT TTCCGAAAAA ATGATATTAG AGGGTTCATT ACTGCTAAAG GAGAATTAAA AGGAAATATT ACTGATCCTG ATATTTCGAT AAACTTTAAT CTTGATTATC CACACTTTAA AGGGATCCGC ATTAGAGAAA CATGGGAGGG AGATATTAAA AATGATAAAA ATTTATTTTT ATTAAATATG AAGGCCAAAA AGTCTCCAAT ACCATCATTT TTAACTATTA AATTTGATTC TGATCTTAAG TTAGATAATT TATCTTTCAG TAGAATTTTT AATTCAAATA AAGGAAGCAT TGAAGTATTT AAAGAGAATA ATAGTTATGT TTGGAAAGCT AATAATTTTC CTCTTGATGA ACTTGAATTA TCTATAGACA AAATTCAATT CGATAGAATT GATGGAATTA TTAATGGTGA GGGATCAATT TCGTCAATCC AGTCATACTT TGATGGGCGA ATTGCTTGGA GTTTAGGCAA ATATGGGAAT ATTAATTTAG CCAATTCATT ATTTGATTTC CGCGTCAAAG ATAATTCTTT TTATATAAAC TCTTCATTGT ATCCAATTGA TGGAGGAATA ATTGAAGTCG AATATGATTC AAATAACAAT AATTTAATTA ATACACAACT CACCAATATT AGTACTAGTT GGACTATCCT AACTGCTTTT GATATTTTTA ATTTTGATAA TAAAAAAGAT ATTCCCATAA GTAAATTTAA TATTTTGGAT GATTTGGAAA TAAATAAAGA TAATAAATCA TTAAAAGAGA GGATCGATTT TATAAAAAAA CTTAAAGAAA GTAATAATGA ATTTGAGGAT AAATTTAACT TAAAAAAATA TATAAGTAAA TTCAAAAGTA GATATGATGG AAACTTAACT ATCAAGGGCG ATAGACCACT TAACTATAAA TTAAATGCAA GATTAAATGG TTATCTTGAT GTTCCTAAAG ATAAGAATAA AAATATCAAA GAGGAATTTG CTATTGATTT GGAGGGAGGA TTATTAAGGG GCAAAGGTTC TTTAAAAATT GAAAATCTTC CGTTGAGCTC TGCAAATATC TTTTTAAATC AGCCAAGAGA TTTTATGGGA GGTTTGGATA TCAATTTATT CTATGATTTG GACAAAAAAT CTTTCTCTAG TGAAATTTCT ACTAATAATT CATCAATAAA AAATAATGAA ATAGTATTTG ATAAAGGATT TATTGAATTC ACTAATTCTA TTTTTGATAT TGATTTATCC TTGCTCATAA ATGATTCCAA AACACCTCTT AATATCAAAG GTGAAATACC TATTGATAGA TCTGATAACT TAGATCTAAG GTTGTTTGGT AATGGAAAAC TTTTTGAATT AATAGAAAAT TTTACTGATG AATTCTTTAC TTTTAAGAAA GGTGACTTGA ACATTAGAAT GATAATAAAA GGAACTCTAA ATAAGCCTAT ATTGAACGGA TTTATTGCGA TTAAAGATTC TGAAGTTGAT CTCTACAACA ATATAATCAA AGATATTAAT AGTTCGATAA TTTTTGATTT TGATTCGGCA CAAATTGAGA ATCTTGAAGC AATCTCTGAA GATTCCGGAA AATTTTTAGT AAAAGGTTTT ATGCCTTTTT ATCAAAATGA TCCTAGAAAA GGAAGGATTA ATCTTAAGAC GAATAAATTT AATATAAAAA CAGATAATTT AAATTTTTTA TTAGATTCAG ATTTGGATTT AACTGGATCA TTTGAAAGTC CTATTTTGGG CGGTTCAATA TCTTTTAATA ATGGATTTTT TAATTTTAAC AGTACCAATC AATCTAATAA AAAAGATAAT AGTAAATTAA AAGAGGATAA AAAAGAATGG CCGGAACTCT TTTGGAATAA TAATGAAAAT ATTGAAATAA TTTCAAATGA AACAATCTTG AATTCAGTTC TTTTAGGAGA AACTTTGCCT AATTATTTGG ATAATTTGTT TTTTGATAAC CTTGTTTTGA AACTGGGACC AGAATTCAAA GTTCAATATT CAGAGATGGT TCAAGCTTAT TTAAATAGTA TTGTGGACCT TAAAATAAAT GGTGGAGTAG GAAAAGATTT AAATGTTAGT GGTCTTATTA AGTTAGAAAA AGGTATAGCG AATCTATATA CTACGCCATT TAAACTTGAT AAAAATAAGG AAAACTATAT TACATTTGCA TCAAGAAGTG GTGTTGTTCC TTATATTATT TTTTCTCTAG TTAGTAAAGT TCCAGATTCT ATAATTCCTA TAAGTGAAAA TAATAAAGAT TCAAACATCT CAGGTGATCT TGATGTAAAT GCGACTTCTA GTGGTTTTGG ATCATTTGGG ATTGGCAATT CAAGGCTTAT CAAAATTGAA GCATCTTATG AAGGGTTTTT AGATCAATTA TCTTTTGCTG ATGAAAATAA AAGAATCCAA TTAAGAAGCA CGCCAAGTTA TAACAGATCA CAAATAATTG GTTTAATTGG AGGGAATTCT GCAAATTTAA TAAATAGGGC ATTTATTTCT CAACTTAATA ATGCTGATGC ATTTAGTGAA AGATTTCAAT TATCTCTATA TCCAGCGTTA ATAGAAAATA ATGATTCATT AAATAATATT TTTTCCAATG AGAATTTAGA TATAGAGAAT GATGGTCAAT CATCTTCTAA TGAAGAATTT TCTTCTCAAG CTTGGGTGGC GGAAATAGGT CTTGATATTA CTGATGCGAT AAATTTTGCC TTCCAAACCG TTCCAGGTAG AGATGATATT TCACCTTTAG GAATTTTGAC TTTTCAGGCA AATCCAAACT TAGAATTATT AGGTTCTTAT GATTCCAATG GGGAATGGAA AAGTCAAGTT CAATTATTTT TTAGATATTA A
|
Protein sequence | MLLPLGFLSS ILLNNFLKET YSSKKLELEK SIENLLDKNV DLGDYEGLRF LGISLGNSKI NDKKNIDSEI KANNVYVGIM PLRSFLKQKW IVKISPKEAA LNIDRDFFKR EKSYENDRIT KKSQSNYELN FNLSKYSILN LKKSGLKTKV KGNVIYKSSN REIIANVKSN FDEKGFLKFK FNTKLNKDFL SLELFSRGLD LDNSEYIIGN RKISFKKGNF KSNFKLIKLP NETFCKGRFS FTNLKIKPDD FAENIDSDST RFLCKDNNLI GNSEKLNYGT LTSNFNLNIP FNRSSNIIAL KGSIGYINSL NPDIQLSGNI PFWFDRRGIN FGDIDTSFKI NRTQLSNLNI FRKNDIRGFI TAKGELKGNI TDPDISINFN LDYPHFKGIR IRETWEGDIK NDKNLFLLNM KAKKSPIPSF LTIKFDSDLK LDNLSFSRIF NSNKGSIEVF KENNSYVWKA NNFPLDELEL SIDKIQFDRI DGIINGEGSI SSIQSYFDGR IAWSLGKYGN INLANSLFDF RVKDNSFYIN SSLYPIDGGI IEVEYDSNNN NLINTQLTNI STSWTILTAF DIFNFDNKKD IPISKFNILD DLEINKDNKS LKERIDFIKK LKESNNEFED KFNLKKYISK FKSRYDGNLT IKGDRPLNYK LNARLNGYLD VPKDKNKNIK EEFAIDLEGG LLRGKGSLKI ENLPLSSANI FLNQPRDFMG GLDINLFYDL DKKSFSSEIS TNNSSIKNNE IVFDKGFIEF TNSIFDIDLS LLINDSKTPL NIKGEIPIDR SDNLDLRLFG NGKLFELIEN FTDEFFTFKK GDLNIRMIIK GTLNKPILNG FIAIKDSEVD LYNNIIKDIN SSIIFDFDSA QIENLEAISE DSGKFLVKGF MPFYQNDPRK GRINLKTNKF NIKTDNLNFL LDSDLDLTGS FESPILGGSI SFNNGFFNFN STNQSNKKDN SKLKEDKKEW PELFWNNNEN IEIISNETIL NSVLLGETLP NYLDNLFFDN LVLKLGPEFK VQYSEMVQAY LNSIVDLKIN GGVGKDLNVS GLIKLEKGIA NLYTTPFKLD KNKENYITFA SRSGVVPYII FSLVSKVPDS IIPISENNKD SNISGDLDVN ATSSGFGSFG IGNSRLIKIE ASYEGFLDQL SFADENKRIQ LRSTPSYNRS QIIGLIGGNS ANLINRAFIS QLNNADAFSE RFQLSLYPAL IENNDSLNNI FSNENLDIEN DGQSSSNEEF SSQAWVAEIG LDITDAINFA FQTVPGRDDI SPLGILTFQA NPNLELLGSY DSNGEWKSQV QLFFRY
|
| |