18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3283 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3283  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  216  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114531  normal  0.185458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1074  hypothetical protein  57.29 
 
 		 97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2091  hypothetical protein  36.36 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5720  hypothetical protein  36.73 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.470242  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3546  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0703945  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2131  hypothetical protein  36.17 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4336  hypothetical protein  33.72 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.022904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0894  hypothetical protein  31.52 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00183124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3576  hypothetical protein  30.59 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.221494  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6474  hypothetical protein  31.03 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1286  hypothetical protein  33.67 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3216500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2065  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2377  hypothetical protein  49.12 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0704345  hitchhiker  0.00399163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1930  hypothetical protein  45.83 
 
 		 93 aa  43.9  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1705  hypothetical protein  29.82 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4610  hypothetical protein  30.3 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553384  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5917  hypothetical protein  42 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.567263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5212  hypothetical protein  42.55 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>