17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2453 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2453  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  474  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.438658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4660  hypothetical protein  29.17 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1312  hypothetical protein  28.21 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.667333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1391  hypothetical protein  22.98 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1943  hypothetical protein  31.36 
 
 		 428 aa  62.8  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12173  hypothetical protein  31.87 
 
 		 361 aa  62.4  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6305  hypothetical protein  34.21 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2336  hypothetical protein  30 
 
 		 354 aa  55.5  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0899485  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0582  hypothetical protein  34.67 
 
 		 378 aa  52.8  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0242426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2578  hypothetical protein  27.96 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.149067 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0582  hypothetical protein  36.9 
 
 		 354 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0866  hypothetical protein  36.36 
 
 		 406 aa  49.3  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0075  hypothetical protein  31.51 
 
 		 343 aa  49.3  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2038  hypothetical protein  34.09 
 
 		 351 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0511  hypothetical protein  21.43 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4814  hypothetical protein  32.18 
 
 		 425 aa  46.2  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3152  hypothetical protein  28.09 
 
 		 466 aa  42.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.416399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>