23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2218 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2218  hypothetical protein  100 
 
 
555 aa  1134    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0528  MutT/NUDIX family protein  62.26 
 
 
560 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0511  MutT/NUDIX family protein  59.59 
 
 
565 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0516  MutT/NUDIX family protein  59.22 
 
 
565 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0483  MutT/nudix family protein  59.85 
 
 
565 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4226  MutT/nudix family protein  53.69 
 
 
599 aa  585  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500357  normal  0.363608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2502  hypothetical protein  41.18 
 
 
545 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.233242  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2237  MutT/NUDIX family protein  37.99 
 
 
565 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0855857  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1049  hypothetical protein  37.72 
 
 
562 aa  363  6e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0715894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03446  putative orphan protein  36.63 
 
 
564 aa  348  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4243  hypothetical protein  34.38 
 
 
552 aa  326  7e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422157  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1775  putative orphan protein  38.12 
 
 
555 aa  324  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1178  hypothetical protein  33.15 
 
 
576 aa  317  4e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3447  Zn-dependent hydrolase  32.1 
 
 
574 aa  298  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2215  TPR repeat-containing protein  83.02 
 
 
177 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0824414  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3161  hypothetical protein  25.52 
 
 
664 aa  80.9  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2965  hypothetical protein  25.36 
 
 
668 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.711778  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3045  dipeptidyl-peptidase III  27.13 
 
 
706 aa  74.3  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_002950  PG0317  M49 family peptidase  25.43 
 
 
886 aa  72.8  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.620339 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3053  hypothetical protein  24.95 
 
 
664 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07015  putative dipeptidyl-peptidase III  24.64 
 
 
671 aa  66.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2908  hypothetical protein  25.81 
 
 
663 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0753895 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88224  dipeptidyl-peptidase III (DPP III) (Dipeptidyl aminopeptidase III) (Dipeptidyl arylamidase III)  23.17 
 
 
693 aa  45.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.01841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>