16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2215 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2215  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 177 aa  353  5.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0824414  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2218  hypothetical protein  83.02 
 
 		 555 aa  179  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0516  MutT/NUDIX family protein  56.19 
 
 		 565 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0511  MutT/NUDIX family protein  56.19 
 
 		 565 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203368  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0483  MutT/nudix family protein  54 
 
 		 565 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0528  MutT/NUDIX family protein  56.18 
 
 		 560 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4226  MutT/nudix family protein  45.36 
 
 		 599 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500357  normal  0.363608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2502  hypothetical protein  47.47 
 
 		 545 aa  80.9  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.233242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4243  hypothetical protein  31.03 
 
 		 552 aa  53.9  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1775  putative orphan protein  33.68 
 
 		 555 aa  52.4  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03446  putative orphan protein  27.06 
 
 		 564 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2237  MutT/NUDIX family protein  23.91 
 
 		 565 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0855857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3447  Zn-dependent hydrolase  28.71 
 
 		 574 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1049  hypothetical protein  27.78 
 
 		 562 aa  42.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0715894  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1250  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  37.84 
 
 		 252 aa  42  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.901782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  40.58 
 
 		 639 aa  40.8  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>