14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1694 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1694  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  374  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0283  hypothetical protein  35.81 
 
 		 167 aa  89  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0545419  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2338  hypothetical protein  38.3 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0431424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2293  hypothetical protein  38.3 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2617  hypothetical protein  38.3 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53059  normal  0.0347471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3900  hypothetical protein  34.03 
 
 		 177 aa  84.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703088  normal  0.015774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3612  hypothetical protein  32.61 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0090  hypothetical protein  39.68 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3019  hypothetical protein  28.79 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2085  hypothetical protein  25.76 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647658  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1847  hypothetical protein  30.91 
 
 		 170 aa  51.6  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.211856  normal  0.427536 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3642  hypothetical protein  35.87 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0214  hypothetical protein  36.47 
 
 		 170 aa  48.1  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02213  hypothetical protein  18.79 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>