16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1057 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1057  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  776    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3160  hypothetical protein  30.55 
 
 		 396 aa  123  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.44575  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3242  hypothetical protein  29.43 
 
 		 489 aa  93.6  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0235  hypothetical protein  37.62 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1186  hypothetical protein  23.94 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1789  hypothetical protein  23.24 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1418  hypothetical protein  26.35 
 
 		 443 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6294  hypothetical protein  48.39 
 
 		 455 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2360  hypothetical protein  25.19 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5084  hypothetical protein  46.27 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000765562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3225  hypothetical protein  23.66 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5348  hypothetical protein  32.05 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6291  hypothetical protein  24.19 
 
 		 425 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5049  hypothetical protein  42.55 
 
 		 216 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5498  hypothetical protein  25 
 
 		 485 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0138442  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3285  hypothetical protein  25.8 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>