17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0582 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0582  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  716    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4814  hypothetical protein  23.81 
 
 
425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1312  hypothetical protein  27.97 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.667333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4660  hypothetical protein  21.11 
 
 
322 aa  106  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0866  hypothetical protein  28.92 
 
 
406 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3152  hypothetical protein  30.53 
 
 
466 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.416399 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0075  hypothetical protein  27.76 
 
 
343 aa  94  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0582  hypothetical protein  32.98 
 
 
378 aa  94  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0242426  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12173  hypothetical protein  22.92 
 
 
361 aa  89.7  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6305  hypothetical protein  37.78 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2038  hypothetical protein  26.18 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2336  hypothetical protein  32.08 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0899485  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2578  hypothetical protein  40.91 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.149067 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0511  hypothetical protein  40.45 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1391  hypothetical protein  27.5 
 
 
245 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1943  hypothetical protein  26.09 
 
 
428 aa  53.5  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2453  hypothetical protein  36.9 
 
 
233 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.438658  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>