20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0540 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0540  hypothetical protein  100 
 
 		 532 aa  1056    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3977  hypothetical protein  43.49 
 
 		 565 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1084  hypothetical protein  38.5 
 
 		 671 aa  312  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0110678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1493  hypothetical protein  42.09 
 
 		 505 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.22386  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03692  hypothetical protein  40.48 
 
 		 517 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.274894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0489  hypothetical protein  38.27 
 
 		 540 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0248447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2869  hypothetical protein  34.97 
 
 		 545 aa  231  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2800  hypothetical protein  34.58 
 
 		 545 aa  228  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3863  hypothetical protein  37.82 
 
 		 530 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1178  hypothetical protein  25.9 
 
 		 496 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2248  hypothetical protein  22.8 
 
 		 495 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000920075  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0170  hypothetical protein  29.08 
 
 		 517 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0629  hypothetical protein  28 
 
 		 513 aa  123  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0300  hypothetical protein  24.18 
 
 		 498 aa  113  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2033  hypothetical protein  26.81 
 
 		 499 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0380  hypothetical protein  25.66 
 
 		 540 aa  100  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5502  hypothetical protein  27.89 
 
 		 529 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000845668  decreased coverage  0.000369985 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0247  hypothetical protein  25.07 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2614  hypothetical protein  25.98 
 
 		 509 aa  82  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000491274  normal  0.0136523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0871  hypothetical protein  24.94 
 
 		 492 aa  62  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>