23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2935 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2935  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  342  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3037  hypothetical protein  49.69 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.362619  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1114  hypothetical protein  60.24 
 
 
111 aa  95.9  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.10293  normal  0.465972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2801  hypothetical protein  46.23 
 
 
162 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3240  hypothetical protein  59.42 
 
 
158 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2463  hypothetical protein  54.69 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.042931  normal  0.181289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2115  hypothetical protein  48.53 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1530  hypothetical protein  50.7 
 
 
108 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.010116  normal  0.139941 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5643  hypothetical protein  54.55 
 
 
92 aa  62  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.495939  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5850  hypothetical protein  37.76 
 
 
139 aa  61.6  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.980958  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2832  hypothetical protein  54.22 
 
 
157 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0471494  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2201  hypothetical protein  55.36 
 
 
96 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5556  hypothetical protein  60 
 
 
108 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563792  hitchhiker  0.000681675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2504  hypothetical protein  52.63 
 
 
98 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325794  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5198  hypothetical protein  41.79 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.261014  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4117  hypothetical protein  49.23 
 
 
139 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690981  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3723  hypothetical protein  45 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0432  hypothetical protein  51.79 
 
 
164 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3741  hypothetical protein  48.33 
 
 
148 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3681  hypothetical protein  45.61 
 
 
106 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4631  hypothetical protein  45 
 
 
165 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0537767  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4264  hypothetical protein  43.33 
 
 
162 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134049 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4549  hypothetical protein  38.18 
 
 
126 aa  42  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>