22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2702 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2702  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  179  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0227124  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4017  hypothetical protein  92.05 
 
 
88 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4329  hypothetical protein  82.95 
 
 
88 aa  146  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2379  hypothetical protein  76.14 
 
 
88 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.630868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1241  hypothetical protein  83.33 
 
 
87 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1126  hypothetical protein  84.42 
 
 
87 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal  0.683214 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1259  hypothetical protein  75.61 
 
 
87 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1478  hypothetical protein  45.12 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1756  hypothetical protein  52.7 
 
 
87 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.886984  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0685  hypothetical protein  55.71 
 
 
87 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0756  hypothetical protein  47.14 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.477341  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3986  hypothetical protein  57.14 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00087868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4301  hypothetical protein  56.34 
 
 
99 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.368926  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4670  hypothetical protein  56.34 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.888175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4819  hypothetical protein  55.71 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal  0.27545 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1464  hypothetical protein  39.24 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0670  hypothetical protein  34.21 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0663  hypothetical protein  34.21 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.358375  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2616  hypothetical protein  32.86 
 
 
85 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.363218  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1015  hypothetical protein  38.03 
 
 
85 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737954  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0708  hypothetical protein  38.03 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1167  hypothetical protein  36.62 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718509  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>