33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2168 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2168  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  433  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0136953  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2571  hypothetical protein  89.6 
 
 		 202 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.520681  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3278  type IV pilus assembly PilZ  79.29 
 
 		 203 aa  332  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.378202  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2147  type IV pilus assembly PilZ  78.28 
 
 		 203 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3133  type IV pilus assembly PilZ  78.92 
 
 		 204 aa  331  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3901  type IV pilus assembly PilZ  80.63 
 
 		 203 aa  331  6e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5217  hypothetical protein  81.58 
 
 		 202 aa  329  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679888  normal  0.230089 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1725  type IV pilus assembly PilZ  53.33 
 
 		 202 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4632  type IV pilus assembly PilZ  46.7 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5127  type IV pilus assembly PilZ  49.47 
 
 		 209 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2533  type IV pilus assembly PilZ  48.74 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2258  type IV pilus assembly PilZ  48.74 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2215  type IV pilus assembly PilZ  48.74 
 
 		 207 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.190978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3234  type IV pilus assembly PilZ  48.66 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1855  type IV pilus assembly PilZ  53.04 
 
 		 203 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0262273  normal  0.0162783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2055  type IV pilus assembly PilZ  52.49 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1043  type IV pilus assembly PilZ  44.85 
 
 		 202 aa  185  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2200  hypothetical protein  47.37 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1935  type IV pilus assembly PilZ  45.18 
 
 		 201 aa  178  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2643  type IV pilus assembly PilZ  35.64 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.615004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5681  hypothetical protein  36.36 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637324  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1802  type IV pilus assembly PilZ  37.8 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1695  type IV pilus assembly PilZ  35.2 
 
 		 243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0558499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4015  hypothetical protein  33.69 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969553  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4427  type IV pilus assembly PilZ  38.12 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1075  type IV pilus assembly PilZ  35.63 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0474711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0235  type IV pilus assembly PilZ  31.67 
 
 		 185 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4163  type IV pilus assembly PilZ  35.43 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3224  type IV pilus assembly PilZ  24.24 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3033  type IV pilus assembly PilZ  25.32 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0616001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3257  type IV pilus assembly PilZ  25.32 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5084  type IV pilus assembly PilZ  23.21 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0293715 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1395  type IV pilus assembly PilZ  31.25 
 
 		 417 aa  41.2  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.074973  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>