29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1428 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1428  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  608  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.679604 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2446  hypothetical protein  77.29 
 
 
296 aa  471  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.33058  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3312  hypothetical protein  66.67 
 
 
290 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0618924  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2409  hypothetical protein  68.77 
 
 
286 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.186986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3545  hypothetical protein  65.59 
 
 
288 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3042  hypothetical protein  66.55 
 
 
273 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539161  normal  0.260589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4750  hypothetical protein  69.32 
 
 
285 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.838034 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1346  hypothetical protein  43.87 
 
 
302 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5259  protein of unknown function DUF1849  43.25 
 
 
293 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245499  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1867  hypothetical protein  43.56 
 
 
299 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5187  hypothetical protein  41.38 
 
 
288 aa  215  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.62549 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4720  hypothetical protein  41.38 
 
 
288 aa  215  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7421  hypothetical protein  39.26 
 
 
284 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1791  hypothetical protein  39.54 
 
 
302 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.294448  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6683  hypothetical protein  39.26 
 
 
285 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2028  hypothetical protein  34.16 
 
 
279 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0094929  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3794  hypothetical protein  35.19 
 
 
273 aa  169  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.437182 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1124  hypothetical protein  35.51 
 
 
272 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1121  hypothetical protein  35.29 
 
 
280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.619187  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1164  hypothetical protein  35.29 
 
 
280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1775  hypothetical protein  34.88 
 
 
278 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1578  hypothetical protein  34.5 
 
 
278 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.767865  normal  0.508227 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2529  hypothetical protein  33.47 
 
 
272 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1380  hypothetical protein  30.1 
 
 
278 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2808  hypothetical protein  27.34 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  0.727732 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0582  hypothetical protein  27.51 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104699  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2069  hypothetical protein  27.02 
 
 
283 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0157  hypothetical protein  24.1 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0449  Domain of unknown function DUF1849  25 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>