28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4380 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4380  sucraseferredoxin family protein  100 
 
 
284 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102429  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4377  sucraseferredoxin family protein  48.15 
 
 
303 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0587956  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1340  Sucraseferredoxin family protein  47.58 
 
 
268 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421578  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13820  uncharacterized conserved protein with thioredoxin-like domain  36.95 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544506  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02490  uncharacterized conserved protein with thioredoxin-like domain  39.66 
 
 
302 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0338  sucraseferredoxin family protein  35.36 
 
 
300 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248903  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5251  sucraseferredoxin-like protein  36.06 
 
 
295 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5340  sucraseferredoxin family protein  36.06 
 
 
295 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.901473  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5631  sucraseferredoxin family protein  36.06 
 
 
295 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3280  Sucraseferredoxin family protein  39.48 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6685  hypothetical protein  37.93 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2240  sucraseferredoxin family protein  38.21 
 
 
301 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.100946 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3065  Sucraseferredoxin family protein  34.51 
 
 
308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000185478  hitchhiker  0.00205688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1766  Sucraseferredoxin family protein  37.85 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5270  Sucraseferredoxin family protein  38.34 
 
 
314 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1795  Sucraseferredoxin family protein  33.69 
 
 
312 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00301305  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2908  Sucraseferredoxin family protein  30.6 
 
 
294 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0955  Sucraseferredoxin family protein  37.83 
 
 
313 aa  93.6  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.886609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8095  Sucraseferredoxin family protein  40 
 
 
234 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3033  sucraseferredoxin-like  25.62 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.262955  hitchhiker  0.00219158 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4480  sucraseferredoxin family protein  25.96 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2831  hypothetical protein  26.32 
 
 
331 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2755  sucraseferredoxin-like  37.19 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1040  sucraseferredoxin-like protein  30.63 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1568  sucraseferredoxin family protein  25.37 
 
 
327 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5760  Sucraseferredoxin family protein  24.68 
 
 
340 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4698  sucraseferredoxin family protein  36.09 
 
 
333 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4340  hypothetical protein  33 
 
 
325 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>