22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4224 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4224  hypothetical protein  100 
 
 		 566 aa  1135    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2950  hypothetical protein  30.56 
 
 		 596 aa  227  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0752  hypothetical protein  32.75 
 
 		 647 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0297875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3208  hypothetical protein  30.41 
 
 		 624 aa  226  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.715837  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2908  hypothetical protein  32.47 
 
 		 617 aa  209  9e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0456  hypothetical protein  32.38 
 
 		 604 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0108814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5256  hypothetical protein  29.86 
 
 		 612 aa  176  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6511  hypothetical protein  30.19 
 
 		 587 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4772  hypothetical protein  24.61 
 
 		 584 aa  153  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.389594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1680  hypothetical protein  27.32 
 
 		 618 aa  141  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0992  hypothetical protein  28.11 
 
 		 585 aa  141  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0838  hypothetical protein  28.08 
 
 		 585 aa  140  4.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.351988  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0955  hypothetical protein  28.51 
 
 		 588 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0769  hypothetical protein  30.69 
 
 		 619 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0965  hypothetical protein  26.91 
 
 		 588 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0947  hypothetical protein  26.91 
 
 		 588 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642912  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3471  hypothetical protein  28.89 
 
 		 642 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.515969  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3020  hypothetical protein  27.41 
 
 		 641 aa  117  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.216512  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1559  hypothetical protein  24.72 
 
 		 716 aa  111  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1273  hypothetical protein  33.73 
 
 		 591 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722393  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1066  hypothetical protein  32.58 
 
 		 572 aa  65.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0195  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 925 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.39307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>