38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2298 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2298  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7408  integral membrane protein  46.03 
 
 		 242 aa  178  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3317  hypothetical protein  38.79 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3328  hypothetical protein  38.79 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0819356 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3379  hypothetical protein  38.79 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286158  normal  0.154521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2632  hypothetical protein  40.33 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3583  hypothetical protein  38.6 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228317  normal  0.0522713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2931  hypothetical protein  37.23 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3078  hypothetical protein  39.01 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0234116  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1918  hypothetical protein  38.81 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00709075  hitchhiker  0.000212154 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0925  hypothetical protein  39.66 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1857  integral membrane protein  38.56 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07520  hypothetical protein  40.18 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.40957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12247  transmembrane protein  36.7 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1512  hypothetical protein  37.96 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15390  hypothetical protein  43.75 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.920438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1265  hypothetical protein  36.68 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.117366  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3371  hypothetical protein  41.33 
 
 		 280 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1772  putative integral membrane protein  37.96 
 
 		 336 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0927  hypothetical protein  45.28 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3100  hypothetical protein  37.9 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.274656  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1603  integral membrane protein  37.8 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0287365  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13380  hypothetical protein  38.1 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.698481  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3289  integral membrane protein  40.26 
 
 		 243 aa  135  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2110  hypothetical protein  39.01 
 
 		 245 aa  135  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0782163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3140  hypothetical protein  35.35 
 
 		 288 aa  135  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0990  putative integral membrane protein  37.67 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0153454  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0938  putative integral membrane protein  42.37 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1482  hypothetical protein  38.53 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.354113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2036  hypothetical protein  37.67 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.762589  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1597  integral membrane protein  37.33 
 
 		 250 aa  129  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000148596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4894  hypothetical protein  36.87 
 
 		 232 aa  118  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16480  hypothetical protein  33.05 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.693416  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3330  hypothetical protein  32.89 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0172089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3566  hypothetical protein  37.58 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16390  hypothetical protein  32.64 
 
 		 257 aa  100  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185434  normal  0.358137 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0410  hypothetical protein  30.04 
 
 		 277 aa  96.3  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0827  hypothetical protein  29.7 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>