12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1486 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1486  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  414  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2970  hypothetical protein  41.88 
 
 
331 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00184088  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0594  hypothetical protein  33.62 
 
 
271 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0558  hypothetical protein  33.62 
 
 
271 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0684947  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3102  putative carboxylase  33.62 
 
 
271 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3093  putative carboxylase  33.62 
 
 
271 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0621  hypothetical protein  33.62 
 
 
271 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.492624  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00470  hypothetical protein  33.62 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0565  hypothetical protein  33.62 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.474357  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00475  hypothetical protein  33.62 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2233  hypothetical protein  41.28 
 
 
308 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.143209 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0454  hypothetical protein  34.91 
 
 
271 aa  42.4  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0103919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>