34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1308 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1308  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1724  hypothetical protein  42.93 
 
 		 174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0935  hypothetical protein  42.41 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal  0.761399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3874  hypothetical protein  39.58 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1491  hypothetical protein  38.97 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3765  hypothetical protein  40.38 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2371  hypothetical protein  37.36 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0988  hypothetical protein  37.06 
 
 		 166 aa  95.5  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278461  normal  0.303864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1006  hypothetical protein  32.32 
 
 		 185 aa  91.7  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780874  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1690  hypothetical protein  37.63 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0379903  hitchhiker  0.00000515175 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1695  hypothetical protein  33.69 
 
 		 181 aa  86.3  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185996  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1099  hypothetical protein  35.08 
 
 		 164 aa  85.1  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.623925  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29220  protein of unknown function (DUF2017)  30.46 
 
 		 185 aa  84.3  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.942758  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1870  hypothetical protein  35.33 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087636  normal  0.127946 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2584  hypothetical protein  31.38 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2316  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000075431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1961  hypothetical protein  29.69 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1354  Domain of unknown function DUF2017  38.17 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2350  hypothetical protein  32.93 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.394519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11364  transcriptional regulator  31.22 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000273911  normal  0.357351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4295  hypothetical protein  33.73 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20080  protein of unknown function (DUF2017)  33.33 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0919227  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3838  hypothetical protein  32.09 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0721345  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3852  hypothetical protein  32.09 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5655  hypothetical protein  30.5 
 
 		 177 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3926  hypothetical protein  32.09 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.985377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0865  hypothetical protein  32.12 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2740  hypothetical protein  29.81 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1322  Domain of unknown function DUF2017  33.79 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.134617  hitchhiker  0.00216166 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0884  hypothetical protein  33.8 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1057  hypothetical protein  29.02 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10710  hypothetical protein  32.21 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0355904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1288  Domain of unknown function DUF2017  31.44 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08340  hypothetical protein  34.33 
 
 		 255 aa  42.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>