33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1286 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1286  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  688    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07280  hypothetical protein  38.84 
 
 		 362 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.776305  normal  0.0453221 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3246  hypothetical protein  38.03 
 
 		 338 aa  185  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.678761  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0452  hypothetical protein  36.75 
 
 		 353 aa  165  8e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3732  hypothetical protein  36.57 
 
 		 384 aa  159  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2726  hypothetical protein  32.29 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534782  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1702  secreted protein  33.22 
 
 		 356 aa  135  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.417633  normal  0.0125499 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0529  hypothetical protein  30.07 
 
 		 376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308782  hitchhiker  0.00891626 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0173  hypothetical protein  31.46 
 
 		 357 aa  122  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.972629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6122  hypothetical protein  31.9 
 
 		 337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3416  hypothetical protein  33.81 
 
 		 359 aa  112  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000117428  hitchhiker  0.0000237376 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22930  hypothetical protein  31.73 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459753  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1143  hypothetical protein  30.09 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2070  hypothetical protein  29.31 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.379784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12530  hypothetical protein  26.86 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2104  hypothetical protein  29.47 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.243869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0267  hypothetical protein  28.8 
 
 		 315 aa  96.3  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1400  secreted protein  28.15 
 
 		 364 aa  93.6  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5211  hypothetical protein  30.75 
 
 		 355 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0130  hypothetical protein  22.75 
 
 		 373 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1276  hypothetical protein  22.4 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2346  hypothetical protein  24.92 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00115323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2517  hypothetical protein  24 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2608  hypothetical protein  27.39 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2831  hypothetical protein  24.64 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2290  PT repeat-containing protein  28.8 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2113  hypothetical protein  28.37 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0640  PT repeat-containing protein  29.75 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1237  PEGA domain protein  26.8 
 
 		 613 aa  69.3  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3047  hypothetical protein  28.77 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070521  normal  0.601156 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3134  PT repeat-containing protein  24.46 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1532  PT repeat-containing protein  29.62 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.679674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0155  hypothetical protein  22.22 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>