11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0488 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0488  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  750    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.659139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5691  hypothetical protein  32.11 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8331  hypothetical protein  26.69 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6737  hypothetical protein  34.45 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0419  hypothetical protein  27.54 
 
 		 294 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0543  hypothetical protein  26.73 
 
 		 223 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357985 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02800  hypothetical protein  31.49 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0349  hypothetical protein  28.06 
 
 		 294 aa  47.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0256  hypothetical protein  28.22 
 
 		 240 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.257997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1834  hypothetical protein  34.33 
 
 		 719 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.610374  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3758  hypothetical protein  40.79 
 
 		 381 aa  42.7  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000107199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>