30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0559 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  631  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3765  protein of unknown function DUF1022  45.79 
 
 
316 aa  261  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  45.95 
 
 
327 aa  247  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0441  hypothetical protein  39.74 
 
 
307 aa  195  9e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00694854  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0799  hypothetical protein  35.58 
 
 
320 aa  176  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1444  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.56 
 
 
306 aa  152  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  29.7 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  29.63 
 
 
328 aa  82.4  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0656  hypothetical protein  22.65 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  30.69 
 
 
456 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  27.81 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  27.42 
 
 
369 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  27.33 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  27.43 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  29.72 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  26.8 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  26.36 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0476  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  26.62 
 
 
350 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1277  protein of unknown function DUF1022  29.89 
 
 
395 aa  55.8  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000300037  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3079  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  27.61 
 
 
359 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674528 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  28.24 
 
 
366 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  29.13 
 
 
335 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  25.65 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5826  protein of unknown function DUF1022  27.55 
 
 
342 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208847  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  28.19 
 
 
319 aa  52.4  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  28.19 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  28.86 
 
 
324 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3359  protein of unknown function DUF1022  25.34 
 
 
323 aa  47  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.014075  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  26.07 
 
 
335 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  26.03 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>