81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2507 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  49.71 
 
 
178 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  45.16 
 
 
182 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  35.68 
 
 
174 aa  122  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  33.16 
 
 
175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  38.25 
 
 
174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  39.46 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  36.55 
 
 
198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  41.97 
 
 
179 aa  114  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  31.41 
 
 
175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  34.95 
 
 
176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  34.08 
 
 
169 aa  111  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  37.02 
 
 
169 aa  111  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  34.07 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  34.07 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  34.81 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  34.81 
 
 
168 aa  109  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  33.52 
 
 
169 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  33.7 
 
 
208 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  32.97 
 
 
169 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  32.42 
 
 
169 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  32.42 
 
 
169 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  32.42 
 
 
169 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  37.57 
 
 
188 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  34.25 
 
 
169 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  34.25 
 
 
169 aa  105  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  33.52 
 
 
169 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  30.77 
 
 
169 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  30.16 
 
 
180 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  31.87 
 
 
169 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  33.89 
 
 
168 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  32.43 
 
 
212 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  32.96 
 
 
167 aa  101  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  30.43 
 
 
172 aa  101  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  36.11 
 
 
180 aa  99.8  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  31.28 
 
 
168 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  31.76 
 
 
159 aa  96.3  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  31.79 
 
 
179 aa  95.5  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  29.19 
 
 
171 aa  94.7  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  30.86 
 
 
177 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  30.86 
 
 
177 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  29.9 
 
 
221 aa  92.4  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  32.81 
 
 
180 aa  89  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  36.52 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  32.74 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  26.63 
 
 
197 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  28.98 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  29.55 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  25.63 
 
 
197 aa  77.8  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  37.93 
 
 
178 aa  77  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  29.15 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  32.18 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  29.47 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  32.42 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  27.67 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4460  hypothetical protein  33.88 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1445  hypothetical protein  32.43 
 
 
186 aa  62.4  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0482  hypothetical protein  30 
 
 
186 aa  51.2  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0643  hypothetical protein  30 
 
 
186 aa  51.2  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  26.63 
 
 
163 aa  51.2  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1855  hypothetical protein  28.22 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  33.61 
 
 
147 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  27.22 
 
 
163 aa  48.5  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  27.95 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  32.79 
 
 
147 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  32.79 
 
 
147 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5943  hypothetical protein  32.28 
 
 
177 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0572526  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0679  hypothetical protein  35.42 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  26.04 
 
 
167 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  29.53 
 
 
228 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  27.22 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0470  hypothetical protein  37.1 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0466774  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  25.81 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  23.94 
 
 
165 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0195  hypothetical protein  32.35 
 
 
218 aa  42.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  25.81 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  42  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  34.29 
 
 
151 aa  41.6  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  34.29 
 
 
151 aa  41.2  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>