17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1614 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1614  GTP cyclohydrolase IIA  100 
 
 		 251 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1393  GTP cyclohydrolase III  31.15 
 
 		 266 aa  129  6e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0818  GTP cyclohydrolase III  31.52 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.755555  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1403  GTP cyclohydrolase III  30.42 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0505  GTP cyclohydrolase III  30.8 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1233  GTP cyclohydrolase III  30.8 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0458897  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2633  GTP cyclohydrolase IIa  28.86 
 
 		 253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.808385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2188  GTP cyclohydrolase III  26.64 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0683488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1998  GTP cyclohydrolase III  27.35 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1598  GTP cyclohydrolase IIa  26.03 
 
 		 253 aa  98.6  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3329  GTP cyclohydrolase IIa  25.82 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.828115  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1377  GTP cyclohydrolase IIa  25.74 
 
 		 231 aa  85.5  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0982803  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0049  GTP cyclohydrolase IIA  23.71 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0787957  normal  0.474293 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0384  GTP cyclohydrolase IIA  25 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.22559 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1743  GTP cyclohydrolase IIA  22.8 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0670897 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1351  GTP cyclohydrolase IIA  20.83 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0394455 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1123  GTP cyclohydrolase IIA  22.16 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.821112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>