18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3310 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3310  Ribonuclease P  100 
 
 
236 aa  477  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1704  Ribonuclease P  74.89 
 
 
234 aa  356  1.9999999999999998e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2397  Ribonuclease P  61.23 
 
 
230 aa  271  4.0000000000000004e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0960  RNase P subunit p30  57.74 
 
 
240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0946359  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0526  Ribonuclease P  57.26 
 
 
235 aa  263  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277795  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0194  ribonuclease P protein component 3  37.44 
 
 
241 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00291251  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2501  ribonuclease P protein component 3  35.23 
 
 
239 aa  119  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0929909  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1367  RNase P subunit p30  28.63 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1427  ribonuclease P  27.66 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0481  ribonuclease P  27.13 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1207  ribonuclease P  27.13 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1680  RNase P subunit p30  30.28 
 
 
214 aa  72  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1415  ribonuclease P  25.53 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.586306  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1310  ribonuclease P  25.53 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.104784  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2528  RNase P subunit p30  24.75 
 
 
212 aa  58.9  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1824  RNase P/RNase MRP subunit p30-like protein  26.47 
 
 
213 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.824867  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2280  RNase P/RNase MRP subunit p30-like  20.75 
 
 
213 aa  49.7  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1192  hypothetical protein  30.46 
 
 
212 aa  42.7  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.13094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>