19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3200 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3200  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  100 
 
 
116 aa  233  7e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1044  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  84.95 
 
 
93 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0089  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  64.84 
 
 
99 aa  123  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.949378  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1998  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  73.33 
 
 
95 aa  116  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0296724 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0943  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  64.84 
 
 
92 aa  111  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.941817 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1272  putative ribonuclease P subunit RPR2  44.94 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604634  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1734  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  45.05 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0168  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  43.96 
 
 
110 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.736645 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0421  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  42.7 
 
 
101 aa  77.8  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0728  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  43.96 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.154027  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1510  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  42.11 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0219546  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0214  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  38.46 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125403  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1485  hypothetical protein  37.89 
 
 
106 aa  66.6  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000000525267  hitchhiker  0.00254885 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3013  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  38.64 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0671  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  31.52 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1889  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  39.33 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.475377 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0746  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  36.9 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0240663  normal  0.0930395 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1975  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  46.15 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.813085  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0044  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  29.17 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>