23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1790 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1790  Ribonuclease R winged-helix domain protein  100 
 
 
332 aa  655    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152362  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1785  Ribonuclease R winged-helix domain protein  41.55 
 
 
374 aa  257  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2259  hypothetical protein  29.45 
 
 
316 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0291  Ribonuclease R winged-helix domain protein  28.53 
 
 
316 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0321782  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0555  ribonuclease R winged-helix domain-containing protein  30.43 
 
 
322 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.10645  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1647  hypothetical protein  28.61 
 
 
324 aa  103  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1076  hypothetical protein  28.36 
 
 
323 aa  103  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0526  hypothetical protein  28.44 
 
 
317 aa  98.2  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.312307 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1780  Protein of unknown function DUF128  24.49 
 
 
330 aa  97.4  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0218  hypothetical protein  25.63 
 
 
545 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0669  hypothetical protein  27 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00126018  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0999  hypothetical protein  28.4 
 
 
536 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.51453  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0285  hypothetical protein  28.8 
 
 
536 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1629  hypothetical protein  28 
 
 
536 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0961  hypothetical protein  26.41 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1479  hypothetical protein  25 
 
 
536 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.711072  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_834  hypothetical protein  25.87 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.245563  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0852  hypothetical protein  25.1 
 
 
350 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.358911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1751  hypothetical protein  27.57 
 
 
252 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000678533  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2599  hypothetical protein  25.37 
 
 
248 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1504  hypothetical protein  27.54 
 
 
252 aa  53.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2327  hypothetical protein  25.95 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.808055 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1470  hypothetical protein  26.42 
 
 
271 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.284851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>